Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabl6Q5U3K5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rabl6Q5U3K5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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