Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mks1Q5SW45 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mks1Q5SW45 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mks1Q5SW45 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms