Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav3-3Q5R1C3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trav3-3Q5R1C3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trav3-3Q5R1C3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-3Q5R1C3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-3Q5R1C3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-3Q5R1C3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-3Q5R1C3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-3Q5R1C3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-3Q5R1C3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav3-3Q5R1C3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms