Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp48Q3V0C5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp48Q3V0C5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp48Q3V0C5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp48Q3V0C5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms