Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnpc3Q3UZ01 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnpc3Q3UZ01 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnpc3Q3UZ01 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms