Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnga4Q3UW12 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga4Q3UW12 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms