Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slfn4Q3UV66 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn4Q3UV66 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms