Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms