Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2aQ3UP38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cracr2aQ3UP38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cracr2aQ3UP38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms