Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ttll12Q3UDE2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttll12Q3UDE2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttll12Q3UDE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll12Q3UDE2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms