Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp4Q3U4B1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssbp4Q3U4B1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssbp4Q3U4B1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssbp4Q3U4B1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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