Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afvQ3THW5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
H2afvQ3THW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms