Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS9Q3SYG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS9Q3SYG4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BBS9Q3SYG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms