Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms