Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q3KNL4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3KNL4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3KNL4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3KNL4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3KNL4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3KNL4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3KNL4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3KNL4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3KNL4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3KNL4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3KNL4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3KNL4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3KNL4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3KNL4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3KNL4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3KNL4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms