Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPS1Q13098 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPS1Q13098 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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