Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc2Q05020 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoc2Q05020 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoc2Q05020 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms