Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GscQ02591 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GscQ02591 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GscQ02591 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GscQ02591 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GscQ02591 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GscQ02591 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GscQ02591 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GscQ02591 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GscQ02591 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GscQ02591 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GscQ02591 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GscQ02591 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GscQ02591 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GscQ02591 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GscQ02591 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GscQ02591 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GscQ02591 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GscQ02591 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GscQ02591 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GscQ02591 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GscQ02591 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GscQ02591 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GscQ02591 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GscQ02591 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GscQ02591 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GscQ02591 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GscQ02591 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GscQ02591 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GscQ02591 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GscQ02591 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GscQ02591 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GscQ02591 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GscQ02591 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GscQ02591 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GscQ02591 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GscQ02591 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GscQ02591 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GscQ02591 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GscQ02591 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GscQ02591 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GscQ02591 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GscQ02591 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GscQ02591 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GscQ02591 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GscQ02591 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GscQ02591 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GscQ02591 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GscQ02591 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GscQ02591 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GscQ02591 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GscQ02591 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GscQ02591 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GscQ02591 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GscQ02591 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GscQ02591 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GscQ02591 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GscQ02591 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GscQ02591 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GscQ02591 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GscQ02591 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GscQ02591 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GscQ02591 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GscQ02591 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GscQ02591 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GscQ02591 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GscQ02591 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GscQ02591 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GscQ02591 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GscQ02591 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GscQ02591 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GscQ02591 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GscQ02591 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GscQ02591 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GscQ02591 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GscQ02591 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GscQ02591 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GscQ02591 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GscQ02591 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GscQ02591 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GscQ02591 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GscQ02591 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GscQ02591 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GscQ02591 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GscQ02591 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GscQ02591 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GscQ02591 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GscQ02591 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GscQ02591 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GscQ02591 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GscQ02591 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms