Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErfP70459 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ErfP70459 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ErfP70459 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErfP70459 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErfP70459 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErfP70459 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ErfP70459 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErfP70459 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErfP70459 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ErfP70459 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErfP70459 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErfP70459 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ErfP70459 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ErfP70459 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ErfP70459 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ErfP70459 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ErfP70459 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ErfP70459 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ErfP70459 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ErfP70459 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ErfP70459 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ErfP70459 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ErfP70459 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ErfP70459 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ErfP70459 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ErfP70459 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ErfP70459 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ErfP70459 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ErfP70459 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ErfP70459 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ErfP70459 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ErfP70459 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ErfP70459 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ErfP70459 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ErfP70459 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ErfP70459 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ErfP70459 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ErfP70459 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ErfP70459 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ErfP70459 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ErfP70459 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ErfP70459 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ErfP70459 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ErfP70459 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ErfP70459 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ErfP70459 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ErfP70459 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ErfP70459 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ErfP70459 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ErfP70459 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ErfP70459 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ErfP70459 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ErfP70459 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ErfP70459 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ErfP70459 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ErfP70459 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ErfP70459 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ErfP70459 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ErfP70459 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ErfP70459 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ErfP70459 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ErfP70459 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ErfP70459 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ErfP70459 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ErfP70459 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ErfP70459 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ErfP70459 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ErfP70459 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ErfP70459 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ErfP70459 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ErfP70459 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ErfP70459 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ErfP70459 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ErfP70459 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ErfP70459 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ErfP70459 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ErfP70459 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ErfP70459 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ErfP70459 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ErfP70459 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ErfP70459 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ErfP70459 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ErfP70459 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ErfP70459 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ErfP70459 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ErfP70459 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ErfP70459 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ErfP70459 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms