Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl31P62900 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl31P62900 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl31P62900 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms