Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psme3P61290 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psme3P61290 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psme3P61290 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psme3P61290 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Psme3P61290 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme3P61290 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psme3P61290 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme3P61290 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme3P61290 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme3P61290 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms