Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pcbp4P57724 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pcbp4P57724 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pcbp4P57724 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pcbp4P57724 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pcbp4P57724 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pcbp4P57724 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcbp4P57724 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp4P57724 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp4P57724 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms