Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfsf10P50592 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfsf10P50592 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf10P50592 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf10P50592 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfsf10P50592 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms