Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VegfbP49766 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VegfbP49766 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VegfbP49766 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VegfbP49766 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VegfbP49766 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VegfbP49766 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VegfbP49766 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VegfbP49766 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VegfbP49766 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VegfbP49766 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VegfbP49766 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VegfbP49766 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VegfbP49766 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VegfbP49766 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VegfbP49766 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VegfbP49766 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VegfbP49766 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VegfbP49766 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VegfbP49766 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms