Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl11P48298 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl11P48298 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl11P48298 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms