Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msh2P43247 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msh2P43247 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh2P43247 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh2P43247 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Msh2P43247 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh2P43247 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh2P43247 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh2P43247 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Msh2P43247 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh2P43247 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms