Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab21P35282 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab21P35282 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab21P35282 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab21P35282 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab21P35282 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab21P35282 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab21P35282 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rab21P35282 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab21P35282 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab21P35282 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms