Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Saa4P31532 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Saa4P31532 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Saa4P31532 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa4P31532 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms