Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrgP28705 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RxrgP28705 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrgP28705 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrgP28705 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrgP28705 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RxrgP28705 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxrgP28705 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxrgP28705 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RxrgP28705 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxrgP28705 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RxrgP28705 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RxrgP28705 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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