Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn10P28658 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn10P28658 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn10P28658 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms