Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afxP27661 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afxP27661 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afxP27661 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afxP27661 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afxP27661 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afxP27661 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afxP27661 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afxP27661 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms