Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata3P23772 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata3P23772 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata3P23772 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata3P23772 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata3P23772 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata3P23772 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata3P23772 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms