Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfyaP23708 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfyaP23708 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NfyaP23708 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfyaP23708 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NfyaP23708 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfyaP23708 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfyaP23708 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfyaP23708 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfyaP23708 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms