Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggta1P23336 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ggta1P23336 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ggta1P23336 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms