Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmp4P21275 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bmp4P21275 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bmp4P21275 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms