Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NelfeP19426 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NelfeP19426 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NelfeP19426 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NelfeP19426 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NelfeP19426 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NelfeP19426 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NelfeP19426 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NelfeP19426 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NelfeP19426 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NelfeP19426 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfeP19426 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfeP19426 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfeP19426 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfeP19426 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NelfeP19426 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms