Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csn1s1P19228 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csn1s1P19228 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms