Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1P13405 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1P13405 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rb1P13405 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rb1P13405 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rb1P13405 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1P13405 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1P13405 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1P13405 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rb1P13405 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1P13405 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1P13405 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rb1P13405 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rb1P13405 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rb1P13405 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rb1P13405 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rb1P13405 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rb1P13405 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rb1P13405 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rb1P13405 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms