Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl2P10889 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl2P10889 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcl2P10889 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms