Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim1P0C8K7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim1P0C8K7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim1P0C8K7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms