Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tom1O88746 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Tom1O88746 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tom1O88746 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tom1O88746 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tom1O88746 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tom1O88746 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tom1O88746 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tom1O88746 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tom1O88746 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tom1O88746 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tom1O88746 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tom1O88746 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tom1O88746 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tom1O88746 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tom1O88746 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tom1O88746 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tom1O88746 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tom1O88746 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tom1O88746 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tom1O88746 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tom1O88746 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tom1O88746 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms