Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dync1i1O88485 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dync1i1O88485 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dync1i1O88485 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms