Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pitx3O35160 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitx3O35160 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms