Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20918J3QN17 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20918J3QN17 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms