Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pate1E9Q658 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pate1E9Q658 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pate1E9Q658 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms