Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ythdc1E9Q5K9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdc1E9Q5K9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms