Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn2r80E9Q1L0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r80E9Q1L0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r80E9Q1L0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms