Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl41A2AUC9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl41A2AUC9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl41A2AUC9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms