Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfap99A0A140LIX9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfap99A0A140LIX9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cfap99A0A140LIX9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cfap99A0A140LIX9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap99A0A140LIX9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cfap99A0A140LIX9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cfap99A0A140LIX9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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