Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HCN3Q9P1Z3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms